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Determinação da estrutura de proteínas usando restrições derivadas de ligação cruzada em espectrometria de massas: comparação de metodologias computacionais

Sistemas biológicos trabalham como máquinas complexas e altamente coordenadas e, desde o surgimento da Biologia Estrutural, muitos mecanismos e estruturas biológicas foram elucidados. A quantidade considerável de conhecimentos que vem se gerando nessa área devem-se a aplicação de métodos experimenta...

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Bibliographic Details
Main Authors: Santos, Matheus Mantovani dos, Martinez, Leandro
Format: Online
Language:Portuguese
Published: Universidade Estadual de Campinas 2019
Subjects:
Proteínas
Modelagem molecular
Determinação estrutural.
Online Access:https://econtents.sbu.unicamp.br/eventos/index.php/pibic/article/view/1042
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Description
Summary:Sistemas biológicos trabalham como máquinas complexas e altamente coordenadas e, desde o surgimento da Biologia Estrutural, muitos mecanismos e estruturas biológicas foram elucidados. A quantidade considerável de conhecimentos que vem se gerando nessa área devem-se a aplicação de métodos experimentais associados a metodologias computacionais que permitem compreender a dinâmica estrutural de sistemas biológicos. Metodologias computacionais de modelagem molecular, que utilizam as distâncias experimentais como restrições para a determinação estrutural das macromoléculas, usando potenciais estatísticos, modelos baseados em estrutura (SBM) ou métodos de determinação inferencial de estruturas (ISD). O ISD tem se destacado como um método de alta resolução para determinação de estruturas terciárias e quaternárias de proteínas a partir de dados experimentais de espectroscopia de ressonância magnética nuclear (RMN) e de massas empregando ligações cruzadas (XL-MS). No presente trabalho foi possível observar que a alta resolução obtida provém da combinação de técnicas computacionais que empregam inferência bayesina, obtendo parâmetros e modelos de maior precisão, e também de simulated annealing, obtendo maiores espaços conformacionais.
ISSN:2596-1969

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